Επίσης, μεγάλο ενδιαφέρον παρουσιάζει και η πανίδα της περιοχής με κυριότερα καταγεγραμμένα θηλαστικά είδη την αλεπού, το λαγό και πετροπέρδικα, τον φιδαετό, το ενδημικό κοράκι κ.α.

Στον Δρυμό του Αίνου βρίσκει καταφύγιο πληθυσμός αλόγων του είδους ''Εguus cabalus'', τα οποία ζουν σε ημιάγρια κατάσταση. Τα ζώα αυτά παρουσιάζουν κάποιο επιστημονικό ενδιαφέρον (Γενετικό υλικό για ενίσχυση ορισμένων επιθυμητών χαρακτηριστικών), αλλά δημιουργούν και προϋποθέσεις ενός είδους οικοτουρισμού. Τα άλογα αυτά δεν προστατεύονται από κάποιο ειδικό καθεστώς και είναι ευάλωτα από παράγοντες του περιβάλλοντος (Πυρκαγιές, Έλλειψη τροφής και νερού). Για την προστασία του κοπαδιού έχουν κατά καιρούς προταθεί διάφορα μέτρα από την Δ/νση Χωροταξίας & Προστασίας Περιβάλλοντος.

Από το ακρωτήρι Μούντας μέχρι και την παραλία της Ι. Μονής Σισίων, έχουν επισημανθεί τοποθεσίες ωοτοκίας της θαλάσσιας χελώνας " Caretta - Caretta''. Eπίσης στη θαλάσσια περιοχή μεταξύ Πόρου και Σκάλας όπου υπάρχει σύμπλεγμα χερσαίων και υποθαλάσσιων σπηλαίων, είναι αποδεδειγμένη η αναπαραγωγή της Μεσογειακής φώκιας ''Μοnachus-Monachus'' και έχουν καταγραφεί μεγάλες αποικίες νυχτερίδων.